U Medulinu i župi sv. Agneze nalazi se nekoliko crkava u staroj gradskoj jezgri ili u okolici grada. One su uglavnom iz srednjega vijeka te obnovljene u novije vrijeme. Neke su porušene, a ona na groblju je nova i izgrađena 1996. godine. U starom su dijelu crkva sv. Kuzme i Damjana iz 1453., koja je porušena nakon 1905., i crkva sv. Jakova, koja se uklopila u stambene zgrade. Kapela sv. Antuna Padovanskoga također je između zgrada staroga Medulina te ima preslicu bez zvona i kip naslovnoga svetca u svetištu. Romanička crkva sv. Agneze iz 16. st. prvotna je župna crkva. Na lokaciji Barbolan, koji je bio napušten 1464., ostala je samo predromanička crkva sv. Petra. Prema pronađenim kamenim dijelovima crkvenoga namještaja i portala u suhozidovima oko nje datirana je u 1149. godinu. U novije vrijeme obnovljena je 1893., kako je zapisano na spomenploči iz 1928. Kroz Drugi svjetski rat crkva je devastirana te je obnovljena s današnjim izgledom 1999. Ima izbočenu polukružnu sniženu apsidu i zidani trijem na stupovima ispred ulaza. Na pročelju se uzdiže kameni desetometarski zvonik sa zvonom. Na pročelju su dva bočna četvrtasta prozora sa svake strane ulaza. U jednobrodnoj je unutrašnjosti zidani oltar s kipom sv. Petra. Na bočnim su stranama dva uska prozora s lučnim završetcima. Crkvica je zaštićena žičanom ogradom.
U starom je dijelu Medulina crkva sv. Foške, koja je obnovljena 1997., a ima oltar s retablom na kojem je prikazana sv. Foška, sv. Blaž i Blažena Djevica Marija. Crkva sv. Križa na groblju izgrađena je 1996. prema projektu Davora Matticchija. Na njoj je pet kružnih otvora koji simboliziraju pet Isusovih rana. Crkvica je jednobrodna s apsidom i nadstrešnicom ispred pročelja i rozetom iznad ulaza. Oltar joj je kameni, a iza njega je postavljeno raspelo. U župnom su arhivu pohranjeni dekreti fašističke talijanske vlasti (1929. – 1933.) u kojima su ispisana talijanizirana hrvatska prezimena Medulinaca i onih iz okolice.
Objava CRKVA SV. PETRA I DRUGE CRKVE U MEDULINU Skrivene između zgrada u staroj gradskoj jezgri pojavila se prvi puta na Glas Koncila.